厌氧微生物高通量筛选和菌库构建

菌落挑取

微生物菌株高通量筛选一般以96孔板或384孔板规格进行。首先将微生物分离源样品系列稀释,均匀涂抹在固体平板培养基上,培养至微生物菌落成熟。将液体培养基分装至96孔板中,每孔100-200uL。将成熟的单一菌落挑取至培养液培中,培养至菌液浑浊。人工挑取可使用牙签或移液器枪头,也可由全自动菌落挑取仪完成。根据项目和实验需要,可将96孔板中的液培菌液中平行复制到新板或96孔规格的有盖冷藏管,加甘油至终浓度10-20%,-80C保存。剩余菌液可用于下游的高通量功能性筛选或16S测序等。

  • 分离好氧微生物时,所有操作可在一般实验室的有氧环境中进行。

  • 如果分离目标为兼性厌氧菌,可在有氧环境中挑取菌落,然后在厌氧条件下培养。

  • 分离严格厌氧微生物时,固体平板培养微生物、液体培养基移液分装、菌落挑取转接等步骤必须在厌氧手套箱中进行。


高通量操作演示

视频展示的是一款高通量微生物菌落全自动挑取仪。挑取仪上方有一个摄像头,可识别生长成熟的单一菌落,也可进行人工修正确定是否挑取。工作部包含96根钢针,按96孔板规格排列。菌落挑取前,钢针依次用漂白剂消毒,用水漂洗,用酒精消毒,最后加热烘干。计算机程序控制钢针提取菌落的位置。每次只有一根针挑取一个菌落,96根针全部完成挑取后,工作部将96个针头全部浸没到96孔板的液体培养基中完成菌落到液培的转接。转接完成后,钢针依次用漂白剂消毒,用水漂洗,用酒精消毒,最后加热烘干后再进行第二板的菌落挑取。自动挑取仪挑取速度极快,一个小时可以完成10板,差不多是一个人一天的手工挑取的工作进度。

视频展示的是一款高通量冷冻管全自动开盖仪,96孔板规格,非常适合高通量模式下的微生物液培超低温冷冻保存。冷冻管的盖子非常密闭,适合严格厌氧微生物的长期保存。整机体积很小,可放置于厌氧手套箱中,作为厌氧微生物高通量筛选平台的一部分。


厌氧样品/菌种保藏管

适用于厌氧微生物菌种超低温保存。每盒共96管,8X12规格排列,每管底部均有二维码,可用于扫描仪示踪。适合高通量全自动样品转接和厌氧菌库复制。可购置配套的8通道电动开盖器或全自动开盖仪进行高通量操作。盖子可单独购买,重复灭菌。

Thermo Fisher Matrix ScrewTop Tubes,0.2mL、0.5mL、1mL不同体积。


厌氧微生物高通量菌库


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韩如旸 ruyanghan@microreme.com | 微信 RuyangMustang

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韩如旸,厌氧微生物高通量筛选和菌库构建. 2020. 网址:ruyangmicrobio.org/anaerobic-high-throughput.